Older
genes with promoter DHSs are expressed at earlier stages = Les gènes plus
anciens avec des promoteurs DHSs sont exprimés à des stades plus précoces
Younger genes with
promoter DHSs are expressed at later stages = Les gènes plus récents avec des
promoteurs DHSs sont exprimés à des stades plus tardifs
La dynamique du paysage de régulation de la
chromatine au cours des stades précoces de l’embryogénèse humaine reste
inconnue. À l’aide de la méthode de séquençage des sites hypersensibles à la DNase I
(DHS), nous rendons compte du fait que le paysage de l’accessibilité à la chromatine
s’établit graduellement au cours des phases précoces de l’embryogénèse chez l’homme.
Curieusement, les DHSs arborant des motifs de liaison OCT4 sont enrichis au
moment de l’activation du génome zygotique (ZGA) chez l’homme, mais pas chez la
souris. OCT4 contribue systématiquement à la ZGA chez l’homme mais pas chez la
souris. Nous montrons par ailleurs que des promoteurs minimaux établissent
habituellement des DHSs à des stades plus tardifs. De la même façon, des gènes
plus jeunes tendent à établir des promoteurs de DHSs et sont exprimés à des
stades embryonnaires plus tardifs, alors que les gènes plus âgés présentent ces
caractéristiques à des stades plus précoces. De plus, nos données montrent que
les transposons actifs SVA et HERV-K arborent des DHSs et sont hautement
exprimés chez les embryons à un stade précoce de développement, mais pas dans
les tissus différenciés. En résumé, nos données fournissent un point de vue développemental
évolutionnaire pour la compréhension de la régulation génique et de l’expression
des transposons. Lei Gao, et al, dans Cell, publication en ligne en
avant-première, 8 mars 2018
Source
iconographique, légendaire et rédactionnelle : Science Direct / Traduction et adaptation: NZ
