Conception dirigée d'un décalage entre médicament et cible pour optimisation du médicament

"L'équilibre est un compormis entre la tendance vers le minimum d'énergie et la tendance vers de maximum de désordre. Dans ce contexte d'équilibre, le minimum d'énergie se nomme enthalpie et le maximum de désordre, entropie." Source:mendeleiev.cyberscol.qc.ca/.../equi1.htm

 

Les protéines sont des objets dynamiques significatifs, subissant des changements de structure, et qui voient réduire leurs possibilités conformationnelles se fermer au moment de la fixation du ligand. Ainsi, à moins qu'une information dynamique soit incorporée, la conception de médicaments basée sur la structure est alors difficile à réaliser. Même dans une approche dynamique, un scénario de rare occurrence survient; alors que les protéines augmentent en entropie du fait de la liaison du ligand, en amplifiant (augmentant) l'exploration conformationnelle dans le complexe. Dans cette perspective, notre argumentation est que ce mode de liaison est de première importance dans le développement d'un médicament parce que cela permet aux substances - médicament non optimisées de façon conventionnelle d'avoir une capacité de liaison mesurable tout en montrant un décalage tridimensionnel avec la cible. Nous défendons donc une optimisation de l'entropie exploitant l'information dynamique pour la conception de médicaments. Ariel Fernàndez et al, in Trends in Biothechnology - 926, online 8 September 2011, in press.

Source: http://www.sciencedirect.com/ / Traduction et adaptation: NZ