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| A l'aide d'un modèle thermodynamique, le niveau d'expression génique peut être prédit sur le plan quantitatif à partir du nombre et de la force des sites de liaison en compétition pour un facteur de transcription donné (...). Source iconographique et légendaire: http://www.sciencedirect.com/science/journal/aip/00928674 |
Les modèles de transcription sont souvent construits autour de l’image d’une ARN polymérase et de facteurs de transcription (FTs) agissant sur une copie
unique de promoteur. Cependant, la plupart des FTs sont l’objet d’un partage
entre des gènes multiples aux affinités de liaison variées. Au-delà de çà, les
gènes sont souvent présents en grand nombre d’exemplaires - sous forme de
copies identiques multiples sur le chromosome, les plasmides ou les vecteurs
viraux ; et dont le nombre de copies se compte en centaines. À l’aide
d’un modèle thermodynamique, nous caractérisons les interactions entre le
nombre de copies de FTs disponibles et la requête biologique pour un FT donné.
Nous démontrons que le pouvoir prédictif de ce modèle non paramétré dépend du
nombre de copies de FTs et du nombre de sites de liaison disponibles et
leurs affinités respectives ; ce contrôle prédictif comme tel est
important dans la compréhension de la transcription et le souhait de définir de
manière quantitative le rendement des circuits génétiques. Finalement, nous
utilisons ces expériences pour la mesure de la dynamique du nombre de copies de
plasmides à travers tout le cycle cellulaire. Robert C. Brewster et al, dans
Cell, publication en ligne en avant-première, 6 mars 2014
Source : Science Direct /
Traduction et adaptation : NZ
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