 |
Des profils de méthylomes et
transcritomes d’ADN ont été repérés dans les lignées de cellules germinales
prénatales en développement ; la
constatation étant que changements globaux d’expression génique ne
correspondent pas avec les changements globaux de méthylation de l’ADN.
|
La déméthylation globale de l’ADN
chez les êtres humains est un processus fondamental survenant au cours de la
pré-implantation des embryons et au cours de la dédifférenciation à un stade
inférieur de cellules souches pluripotentes ayant déjà amorcé leur
différenciation (cellules souches pluripotentes [PSC] - pluripotent stem cells dans le texte). Cependant, l’étendue de
la reprogrammation de la méthylation de l’ADN dans les cellules de la lignée
germinale humaine reste inconnue.
Ici, nous avons entrepris un
séquençage sur génome entier après traitement au bisulfite de sodium (WGBS –
whole genome bisulfite sequencing dans le
texte) et un séquençage ARN ([RNA-seq], RNA-sequencing dans le texte) de cellules germinales prénatales de 53 à 137 jours
de développement. Nous avons découvert que le transcriptome et le methylome de
la lignée germinale humaine est distincte à la fois des PSCs et de la masse cellulaire interne ([ICM] –
inner cell mass dans le texte) des
blastocystes humains. Nous avons utilisé cette source d’information pour suivre
la déméthylation globale de l’ADN avec réversion vers un état non différencié des
PSCs en phase de différenciation, nous avons mis au jour des points chauds de bas
taux de méthylation des transposons protégés de la déméthylation au niveau de
la lignée germinale et de l’ICM. Prise dans son ensemble, la lignée germinale
humaine représente un outil valable de suivi in vivo de l’épigénome des cellules ayant subi une déméthylation
globale de l’ADN. Sofia Gkountela, et al, dans Cell, publication en ligne en
avant-première, 21 mai 2015
Source iconographique, légendaire et rédactionnelle: Science Direct / Traduction et
adaptation : NZ
Aucun commentaire:
Enregistrer un commentaire