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Une technique appelée TRIBE identifie les cibles cellulaires spécifiques
des protéines de liaison à l’ARN, même sur une petite population de cellules,
par la détection d’événements d’édition d’ARN conférés par la fusion
enzymatique d’une protéine de liaison à l’ARN spécifique.
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Les transcrits ARN sont liés et soumis à régulation par des protéines de
liaison à l’ARN [(-RBPs -), de RNA-binding
proteins dans le texte]. Les méthodes d’identification actuelles de cibles in vivo d’une RBP sont imparfaites et
non adaptables pour l’examen d’un petit nombre de cellules. Afin de répondre à
ces questionnements, nous avons développé la méthode TRIBE (Cibles des
protéines de liaison à l’ARN identifiées par édition [targets of RNA-binding proteins identified by editing dans le texte]),
une technique qui couple une RBP au domaine catalytique de l’enzyme d’édition
de l’ARN ADAR chez Drosophila et
exprime la protéine de fusion in vivo.
Les cibles de RBP sont matérialisées par de nouveaux évènements d’édition d’ARN
et identifiées par séquençage ARN. Nous avons fait usage de TRIBE pour
identifier les cibles de trois RBPs (Hrp48, DFMR1, et NonA). La méthode TRIBE
peut être avantageusement comparée à d’autres méthodes (…), et nous avons pu
identifier les cibles RBPs à partir d’une très faible quantité de matériel
biologique, à savoir 150 neurones spécifiques de mouche. La méthode TRIBE peut
être utilisée sans anticorps et sur de très petites quantités de cellules
spécifiques. Aoife C. McMahon, et al, dans Cell, publication en ligne en
avant-première, 31 mars 2016
Source : Science Direct / Traduction et adaptation : NZ
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