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La stratification des données de protéomique et de génomique des tumeurs
ovariennes fournissent un éclairage de la manière dont les voies de
signalisation correspondent aux réarrangements génomiques et rappellent le
bénéfice de l’utilisation de signatures protéiques pour l’évaluation du pronostic
et de la stratification des traitements.
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Dans le but de fournir une analyse détaillée des composantes moléculaires
des mécanismes sous-jacents associés au cancer de l’ovaire, nous avons effectué
une caractérisation complète par spectrométrie de masse de 174 tumeurs
ovariennes, précédemment analysée à l’aide de l’Atlas Génomique du Cancer
[Cancer Genome Atlas dans le texte] (AGC) ; dont 196
étaient définies comme carcinomes séreux de haut grade (CSHG). L’intégration de
nos mesures de protéomique avec les données génomiques ont donné de nombreux
éclairages de la maladie, comme par exemple la manière dont le taux d’altérations
de copies de genome influent sur le proteome, les protéines associées à l’instabilité
des chromosomes, les différentes voies de signalisation sur lesquels les divers
réarrangements génomiques convergent, et ceux d’entre eux le plus souvent
associés à une survie de courte durée. Des acétylations protéine-spécifiques
associées à une déficience du processus de recombinaison homologue fournit
potentiellement le moyen de stratifier les patients sur le plan thérapeutique.
Outre ce précieux outil, ces résultats définissent le génome somatique comme
force motrice du protéome du cancer et des associations entre protéines et taux
de modifications post-synthèse et issues cliniques du CSHG. Hui Zhang et al,
dans Cell, publication en ligne en avant-première, 29 juin 2016
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