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Le traçage des réseaux d’interactions génétiques
globales dans les cellules humaines, à l’aide des criblages génétiques CRISPR (courtes Répétitions
Palindromiques Groupées et Régulièrement Espacées) dévoile des
interacteurs génétiques clé de type Ras.
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La dépendance génétique des cancers humains présente
de grandes variations selon le type de tumeurs. Ici, nous cataloguons cette
hétérogénéité et en faisons usage pour identifier les interactions géniques
fonctionnelles ainsi que l’influence du génotype sur le déclenchement des
cancers. En utilisant la technique de criblage CRISPR** sur le génome entier,
nous générons une base de données de marqueurs d’essentialité génétique à
l’aide de 14 lignées cellulaires de leucémie myéloïde aigue (LMA). Des
ensembles de gènes présentant des schémas d’essentialité en corrélation à
travers les lignées révèlent des relations nouvelles entre les gènes, les
substrats essentiels des enzymes, ainsi que les fonctions moléculaires des
protéines non-encore caractérisées. Des comparaisons entre des gènes essentiels
s’exprimant de différentes manières, sous la forme de lignées Ras-dépendantes
ou indépendantes, révèlent des « partenaires d’induction de létalité »
de synthèse de l’oncogène Ras. Des criblages génétiques, effectués à la fois
chez des cellules de LMA humaine et chez des cellules pro-B obtenues sur des
modèles de souris transgéniques convergent sur un nombre étonamment peu élevés
de gènes, pour ce qui est des voies de signalisation Ras et MAPK et mettent l’accent
sur PREX1 comme activateur LMA-spécifique de la signalisation MAPK. Nos
résultats suggèrent des stratégies générales de décryptage de réseaux de gènes
et d’intéractions, en exploitant les diversités naturelles génétique et
épigénétique des cellules cancéreuses humaines. Tim Wang, et al, dans Cell,
publication en ligne en avant-première, 2 février 2017
*essentialité : elle est définie
principalement par les caractères phénotypiques qu’elle exprime
**CRISPR : Courtes Répétitions Palindromiques Groupées et
Régulièrement Espacées
Source iconographique, légendaire et rédactionnelle: Science Direct / Traduction et
adaptation : NZ
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