 |
| 18 primary tumors = 18 tumeurs primaires 5 matching LNs = 5 ganglions lymphatiques correspondants Patients with oral cavity HNSCC = Patients atteints de carcinomes à cellules squameuses de la tête et du cou Single cell RNA-sEQ = Séquençage d'ARN au niveau d'une cellule unique Immuno-histochemistry = Immunohistochimie tSNE = visualisation spatiale en deux dimension par ladite technique (réduction de dimension) Epithelial malignant cells = Cellules malignes épithéliales p-EMT malignant cells = Cellules malignes de transition épithélio-mésenchymateuse partielle CAFs = Fibroblastes associés au cancer |
Les diverses cellules malignes dans les tumeurs stromales
et immunitaires influent sur la croissance, la métastatisation et sur la
réponse aux traitements. Nous avons profilé les transcriptomes d’environ 6 000
cellules uniques provenant de patients atteints de carcinomes à cellules
squameuses de la tête et du cou (CCSTC), incluant cinq paires homologues de
tumeurs primaires et de métastases des ganglions lymphatiques. Les cellules stromales
et immunes présentaient des programmes d’expression significatifs dans l’ensemble
des patients. En revanche, les cellules malignes varient au sein d’une même
tumeur et entre les différentes tumeurs pour ce qui est de leur expression de signatures
liées au cycles cellulaires, au stress, à l’hypoxie; et pour ce qui est la différentiation
épithéliale et de la transition épithélio-mésenchymateuse partielle (p-EMT). Les
cellules exprimant le programme p-EMT se localisent, sur le plan spatial, sur
le bord d’attaque des tumeurs primaires. En intégrant les transcriptomes à cellule
unique avec les profils d’expression en masse pour des centaines de tumeurs,
nous affinons les sous-types de CCSTC par type de malignité, composition des cellules
stromales, et profil p-EMT comme prédicteur indépendant de métastatisation des ganglions,
de leur grade et des caractéristiques pathologiques indésirables. Nos résultats
fournissent un éclairage en termes d’écosystème CCSTC et définissent les
interactions stromales et le programme p-EMT associé à la métastatisation.
Sidharth V. Puram, et al, dans Cell, publication en ligne en avant-première, 30
novembre 2017
