Quelques principes généraux de l’organisation
tridimensionnelle (3D) du génome ont récemment été établis, incluant ceux du
positionnement non-aléatoire des chromosomes et des gènes dans le noyau de la
cellule, des compartiments chromatiniens distincts, et des domaines d’associations
topologiques (TADs). Cependant, l’étendue et la nature de la variabilité intercellulaire
et intracellulaire de l’architecture génomique ne sont que peu caractérisées.
Ici, nous examinons l’hétérogénéité de l’organisation du génome. Une
cartographie de centaines d’interactions intra-chromosomales chez des fibroblastes
pris individuellement, présente de faibles fréquences d’association, qui sont déterminées
par la distance génétique, l’architecture chromatinienne de haut niveau, ainsi
que par l’environnement chromatinien. La structure des TADs varie entre les
cellules prises individuellement, et les associations inter-TAD sont
fréquentes. De plus, une analyse au niveau de la cellule unique révèle un
comportement indépendant des allèles pris individuellement au niveau des noyaux
simples. Nos observations révèlent une très grande variabilité et hétérogénéité
de l’organisation du génome au niveau des allèles pris individuellement et
démontrent la coexistence d’un large spectre de configurations génomiques au
sein d’une population donnée de cellules. Elizabeth H. Finn et al, dans Cell,
publication en ligne en avant-première, 21 février 2019
Jusqu'au 30 juin 2022, le blog Actualités Scientifiques - Médicales vous a proposé des traductions en français adaptées de résumés d'articles originaux, tout récemment parus et relayés sur site internet. Actualités Scientifiques - Médicales. A partir du 1er septembre 2022, ce blog vous propose des billets d'opinion relatifs à l'actualité scientifique et médicale, selon un rythme qui reste à définir.
mardi 26 février 2019
#Cell #génome #organisation #3D Hétérogénéité Majeure et Variation Intrinsèque dans l’Organisation Spatiale du Génome
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