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| scRNA-seq of glioblastoma = Séquençage d'ARN d'une cellule unique TCGA deconvolution = Déconvolution à partir de l'Atlas Génomique du Cancer Experimental models = Modèles expérimentaux |
Plusieurs facteurs génétiques, épigénétiques et
développementaux président à l’existence du glioblastome, tumeur incurable
et peu connue; leur caractérisation précise reste un défi. Ici, nous utilisons
une approche intégrative transversale de séquençage d’ARN au niveau d’une
cellule unique de 28 tumeurs, d’analyse génétique et de mesure d’expression
génique de grande ampleur de 401 spécimens de l’Atlas du Génome du Cancer
(TCGA), d’approches fonctionnelles, et du traçage de lignée cellulaire ayant
pour origine une cellule unique ; pour fabriquer un modèle unifié d’états
cellulaires et de diversité génétique du glioblastome. Nous déterminons ainsi
que les cellules malignes de glioblastomes se présentent sous quatre formes
principales d’états cellulaires représentant les différents types de cellules
nerveuses, sont influencées par le microenvironnement tumoral, et sont douées d'une
plasticité. La relative fréquence des cellules représentant chaque stade varie
selon les échantillons de glioblastome et est influencée par le nombre de
copies de gènes résultant de l’amplification des loci CDK4, EGFR, PDGFRA et par
les mutations du locus NF1 ; favorisant chacun un état défini. Notre
travail fournit une ébauche descriptive du glioblastome, intégrant les
programmes des cellules malignes, leur plasticité, et leur modulation par les
divers facteurs génétiques. Cyril Neftel, et al, dans Cell, publication en
ligne en avant-première, 18 juillet 2019
Source iconographique, légendaire et rédactionnelle :
Science Direct / Traduction et
adaptation : NZ
Déconvolution : opération mathématique par
laquelle on récupère un objet intégré dans image dégradée par le bruit et le
flou.
scRNA :
single cell RNA = ARN d’une cellule unique
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